MacGyver wird in eine streng geheime Forschungseinrichtung des US-Militärs gerufen, um dort das Sicherheitssystem zu überprüfen. Wider Erwarten gelingt es ihm, die computergesteuerte Anlage außer Kraft zu setzen und in den Hochsicherheitstrakt vorzudringen. Als er sich nach dem erledigten Auftrag bei der Wissenschaftlerin Jill in der Computerzentrale meldet, entwickelt der Rechner ein Eigenleben und versucht, die beiden zu töten.

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